腹腔鏡檢查
腹腔鏡檢查是所有不孕症檢查項目中最具侵襲性的。腹腔鏡檢查其實就是一種小手術。它需要全身麻醉，腹部穿透兩、三個小傷口，再將腹腔鏡器械放進腹腔內。腹腔鏡可以一覽無遺腹腔內的病變，包括骨盆腔粘連，子宮內膜異位症，輸卵管阻塞，和生殖道畸形等。凡懷疑前述疾病和不明原因的不孕症都可以適用腹腔鏡檢查。腹腔鏡檢查也較具危險性，偶而會傷害到大血管，腸子，或其它器官；特別是骨盆腔粘連或是過胖、過瘦的病人，較易有手術意外傷害。隨著時代的進步，腹腔鏡檢查和腹腔鏡治療愈來愈難區分；檢查時看到病變，往往就可同時治療。不像過去，檢查時開一次刀，治療時還再另開一次刀。
子宮腔鏡檢查
子宮腔鏡檢查純為檢查子宮腔內病變，包括黏膜下肌瘤，黏膜下息肉，子宮內膜炎，子宮腔內粘連，和子宮先天畸形。子宮腔內病變可以用子宮腔鏡作為第一線的檢查，也可以作為子宮輸卵管攝影之後第二線的檢查；子宮腔內病變仍以子宮腔鏡較子宮輸卵管攝影清楚。子宮腔鏡檢查不需要麻醉，也沒有傷口。檢查時如同內診，操作時略有不適，檢查後視需要可以服用消炎止痛藥。子宮腔鏡檢查也常常在腹腔鏡檢查時一併施行。
精液分析
精液分析是男性不孕因素最重要的檢查。施行精液分析，必需規定禁慾天數。若禁慾天數少，則精液量會變少，精虫濃度也變少，但是活動精虫比例則增加。所以必需規定禁慾天數檢驗才有標準。精液分析需以手淫取出精液，並且在一小時內送達檢驗處所。無法以手淫取出精液的人，可以使用威而鋼等藥物幫助勃起；或使用特製不傷害精虫之保險套，以行房取得精液。檢查精虫形態，必需特殊染色，並且仔細評定。坊間檢驗精液多沿用舊法，特別是形態正常精虫比率完全不準。精液分析每次檢查，數據都會有上下變化；甚至同一位病人由超高正常至超低不正常都可能。所以精液分析應該重複檢驗才能確定是否不正常。
